The 4400

Tom en Diana proberen, met hulp van Gary Navarro, T.J. Kim op te sporen, een 4400 waarvan ze denken dat zijn gave ertoe leidde dat een man Dennis Ryland neerstak. Richard en Lily moeten omgaan met Isabelle, die nu volwassen is geworden.

Gary Navarro wordt gearresteerd nadat hij heeft geprobeerd Dennis Ryland te vermoorden. Isabelle pleegt een zelfmoordpoging om haar moeder te redden, maar faalt wanneer ze een val van het dak van het 4400-centrum overleeft.

T.J. Kim wordt vermoord en Tom wordt ervan beschuldigd de moord te hebben gepleegd. Shawn en Isabelle groeien naar elkaar toe.

Tom en Diana zoeken naar iemand die jonge 4400's ontvoert. Shawn wordt bedreigd door de Nova Group.

In een van Alana's fantasieën zien Tom en Alana Maia, hoewel ze zich haar niet herinneren. Diana's leven wordt bedreigd, en Tom sluit een deal met de toekomst om de geschiedenis recht te zetten.

Isabelle zoekt wraak op de Nova Group nadat zij Shawn aanvallen. Alana confronteert de man die negen jaar geleden haar man en zoon om het leven bracht bij een auto-ongeluk.

Met hulp van Dennis Ryland spoort NTAC de overgebleven leden van de Nova Group op. Nikki brengt Shawn een onverwacht bezoek.

Tom en Diana worden gedrogeerd met een hallucinogeen dat is gemaakt van een olie die wordt afgescheiden door de handen van een 4400.

Kevin Burkhoff wordt een gezochte man wanneer zijn onderzoek naar promicin wordt ontdekt. Tom en Diana zoeken naar Kevin, maar ontdekken hoe ver hij zal gaan om zijn werk te beschermen.

Tom en Diana's onderzoek naar een reeks gruwelijke moorden leidt hen naar een nieuwe samenzwering binnen de overheid. In het 4400-centrum ontvangt Shawn een geschenk van een andere teruggekeerde dat hem zijn toekomst laat zien.

NTAC en het 4400-centrum werken samen om Jordan Collier te vinden. Kyle Baldwin krijgt een onverwachte bezoeker in de staatsgevangenis.

Leden van de Nova Group die in hechtenis waren bij NTAC ontsnappen uit de gevangenis met hulp van buitenaf door Jordan Collier. Shawn en Richard ontdekken dat Isabelle samenwerkt met Dennis Ryland.

Tom en Diana zetten hun onderzoek voort naar Jordan Collier's plan voor de mensheid. Dennis Ryland keert terug bij NTAC en Isabelle raakt ernstig gewond wanneer ze een klaslokaal gijzelt.